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Enregistrement W1756245074 · doi:10.1167/iovs.15-16587

Functional Impact of Collagens on the Activity Directed by the Promoter of the<i>α5</i>Integrin Subunit Gene in Corneal Epithelial Cells

2015· article· en· W1756245074 sur OpenAlexafffund
Jennifer Lake, Karine Zaniolo, Marie-Ève Gingras, Camille Couture, Christian Salesse, Sylvain L. Guérin

Notice bibliographique

RevueInvestigative Ophthalmology & Visual Science · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCorneal Surgery and Treatments
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMolecular biologyGene expressionWound healingBiologyFibronectinTranscription (linguistics)GeneProtein subunitCell biologyIntegrinExtracellular matrixImmunologyBiochemistryCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: The early step of corneal wound healing is characterized by the massive production of fibronectin (FN), whose secretion is progressively replaced by collagens from the basal membrane as wound healing proceeds. Here, we examined whether expression of the gene encoding the α5 subunit from the FN-binding integrin α5β1 changes as corneal epithelial cells (CECs) are cultured in the presence of collagen type I (CI) or type IV (CIV). METHODS: Responsiveness of the α5 gene toward collagen was determined by transfection of α5 promoter/chloramphenicol acetyltransferase (CAT) plasmids into rabbit and human CECs cultured on BSA or collagens. Electrophoretic mobility shift assays and Western blots were used to monitor the transcription factors required for basal α5 gene transcription in the presence of collagens. Gene profiling on microarrays was used to determine the impact of collagens on the patterns of genes expressed by CECs. RESULTS: All collagen types repressed the full-length α5/CAT promoter activity in confluent CECs. A moderate increase was observed in subconfluent rabbit CECs grown on CIV but not on CI. These collagen-dependent regulatory influences also correlated with alterations in the transcription factors Sp1/Sp3, NFI, and AP-1 that ensure α5 gene basal transcription. Microarray analyses revealed that CI more profoundly altered the pattern of genes expressed by human CECs than CIV. CONCLUSIONS: Collagens considerably suppressed α5 gene expression in CECs, suggesting that during wound healing, they may interfere with the influence FN exerts on CECs by altering their adhesive and migratory properties through a mechanism involving a reduction in α5 gene expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,294
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,004
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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