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Enregistrement W1759034059 · doi:10.1111/j.1462-2920.2007.01282.x

Isotope analysis as a natural reaction probe to determine mechanisms of biodegradation of 1,2‐dichloroethane

2007· article· en· W1759034059 sur OpenAlexafffund
Sarah Hirschorn, Mary Joyce A. Dinglasan-Panlilio, Elizabeth A. Edwards, Georges Lacrampe‐Couloume, Barbara Sherwood Lollar

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Microbiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial bioremediation and biosurfactants
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaU.S. Environmental Protection Agency
Mots-clésBiodegradationIsotope analysisFractionationEnvironmental chemistryDegradation (telecommunications)Isotope fractionationElectron acceptorKinetic isotope effectIsotopes of carbonIsotopeStable isotope ratioChemistryChromatographyTotal organic carbonBiologyOrganic chemistryDeuteriumEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

1,2-Dichloroethane (1,2-DCA), a chlorinated aliphatic hydrocarbon, is a well-known groundwater contaminant. In this study, fractionation of stable carbon isotope values of 1,2-DCA during biodegradation was used as a novel reaction probe to provide information about the mechanism of 1,2-DCA biodegradation under both aerobic (O2-reducing) and anaerobic (NO3-reducing) conditions. Under O2-reducing conditions, an isotopic enrichment value (epsilon) of -25.8 +/- 1.1 per thousand (+/-95% confidence intervals) was measured for the enrichment culture. Under NO3-reducing conditions, an epsilon-value of -25.8 +/- 3.5 per thousand was measured. The microbial culture produced isotopic enrichment values (epsilon) that are not only large and reproducible, but also are the same whether O2 or NO3 was used as an electron acceptor. Combining data measured under both O2- and NO3-reducing conditions, an isotopic enrichment value (epsilon) of -25.8 +/- 1.6 per thousand is measured for the microbial culture during 1,2-DCA degradation. The epsilon-value can be converted into a kinetic isotope effect (KIE) value to relate the observed isotopic fractionation to the mechanism of degradation. This KIE value (1.05) is consistent with degradation via hydrolytic dehalogenation under both electron-accepting conditions. This study demonstrates the added value of compound-specific isotope analysis not only as a technique to verify the occurrence and extent of biodegradation in the field, but also as a natural reaction probe to provide insight into the enzymatic mechanism of contaminant degradation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,076
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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