MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1760603991 · doi:10.4049/jimmunol.180.9.5907

HIV-1-Specific T Cell Precursors with High Proliferative Capacity Correlate with Low Viremia and High CD4 Counts in Untreated Individuals

2008· article· en· W1760603991 sur OpenAlexaff
Sandra A. Calarota, Andrea Foli, Renato Maserati, Fausto Baldanti, Stefania Paolucci, Mary Young, Christos Tsoukas, Julianna Lisziewicz, Franco Lori

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Cancer InstituteNational Center for Research ResourcesNational Institute of Child Health and Human DevelopmentEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute on Drug Abuse
Mots-clésELISPOTViremiaImmunologyPeripheral blood mononuclear cellT cellBiologyVirologyImmune systemIn vitroHuman immunodeficiency virus (HIV)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Evidences have recently suggested that the preservation of vaccine-induced memory rather than effector T cells is essential for better outcome and survival following pathogenic SIV challenge in macaques. However, an equivalent demonstration in humans is missing, and the immune correlates of HIV-1 control have been only partially characterized. We focused on the quantification of Ag-specific T cell precursors with high proliferative capacity (PHPC) using a peptide-based cultured IFN-gamma ELISPOT assay (PHPC assay), which has been shown to identify expandable memory T cells. To determine which responses correlate with viral suppression and positive immunologic outcome, PBMC from 32 chronically untreated HIV-1-infected individuals were evaluated in response to peptide pools, representing the complete HIV-1 Gag, Nef, and Rev proteins, by PHPC and IFN-gamma ELISPOT assay, which instead identifies effector T cells with low proliferative capacity. High magnitude of Gag-specific PHPC, but not ELISPOT, responses significantly correlated with low plasma viremia, due to responses directed toward p17 and p15 subunits. Only Gag p17-specific PHPC response significantly correlated with high CD4 counts. Analysis of 20 additional PBMC samples from an independent cohort of chronically untreated HIV-1-infected individuals confirmed the correlation between Gag p17-specific PHPC response and either plasma viremia (inverse correlation) or CD4 counts (direct correlation). Our results indicate that the PHPC assay is quantitatively and qualitatively different from the ELISPOT assay, supporting that different T cell populations are being evaluated. The PHPC assay might be an attractive option for individual patient management and for the design and testing of therapeutic and prophylactic vaccines.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of ImmunologyMême sujetHIV Research and TreatmentTravaux en français237 207