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Enregistrement W1766945816 · doi:10.18632/oncotarget.1627

Post-transcriptional regulation of MRE11 expression in muscle-invasive bladder tumours

2014· article· en· W1766945816 sur OpenAlexafffundabout
Rebecca Martin, Martin Kerr, Mark Teo, Sarah J. Jevons, Marianne Koritzinsky, Bradly G. Wouters, Selina Bhattarai, Anne E. Kiltie

Notice bibliographique

RevueOncotarget · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBladder and Urothelial Cancer Treatments
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute for Health and Care ResearchCancer Research UK
Mots-clésBladder cancerCystectomyMedicinemicroRNARadiation therapyCancerCancer researchPathologyOncologyInternal medicineBiologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

// Rebecca M. Martin 1 , Martin Kerr 1 , Mark T.W. Teo 2 , Sarah J. Jevons 1 , Marianne Koritzinsky 3 , Bradly G. Wouters 3 , Selina Bhattarai 4 , Anne E. Kiltie 1 1 Gray Institute for Radiation Oncology and Biology, Department of Oncology, University of Oxford, Oxford, UK 2 Section of Epidemiology and Biostatistics, Leeds Institute of Cancer and Pathology, Leeds, UK 3 Princess Margaret Cancer Centre, University Health Network, Toronto, Canada and Department of Radiation Oncology, University of Toronto, Toronto, Canada 4 Department of Histopathology and Molecular Pathology, St James’s University Hospital, Leeds, UK Correspondence: Anne E Kiltie, email: // Key words : MRE11, bladder cancer, post-transcriptional regulation, microRNA, miR-153, protein stability Received : November 25, 2013 Accepted : January 14, 2014 Published : January 14, 2014 Abstract Predictive assays are needed to help optimise treatment in muscle-invasive bladder cancer, where patients can be treated by either cystectomy or radical radiotherapy. Our finding that low tumour MRE11 expression is predictive of poor response to radiotherapy but not cystectomy was recently independently validated. Here we investigated further the mechanism underlying low MRE11 expression seen in poorly-responding patients. MRE11 RNA and protein levels were measured in 88 bladder tumour patient samples, by real-time PCR and immunohistochemistry respectively, and a panel of eight bladder cancer cell lines was screened for MRE11, RAD50 and NBS1 mRNA and protein expression. There was no correlation between bladder tumour MRE11 protein and RNA scores (Spearman’s rho 0.064, p=0.65), suggesting MRE11 is controlled post-transcriptionally, a pattern confirmed in eight bladder cancer cell lines. In contrast, NBS1 and RAD50 mRNA and protein levels were correlated (p=0.01 and p=0.03, respectively), suggesting primary regulation at the level of transcription. MRE11 protein levels were correlated with NBS1 and RAD50 mRNA and protein levels, implicating MRN complex formation as an important determinant of MRE11 expression, driven by RAD50 and NBS1 expression. Our findings of the post-transcriptional nature of the control of MRE11 imply that any predictive assays used in patients need to be performed at the protein level rather than the mRNA level.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,735
Score d'incertitude au seuil0,720

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2014
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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