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Enregistrement W1767499484

Genetic factors correlated with survival in colorectal cancer: validation studies in patients from Newfoundland and Labrador

2012· dissertation· en· W1767499484 sur OpenAlexaboutno aff
Amit A. Negandhi

Notice bibliographique

RevueMemorial University Research Repository (Memorial University) · 2012
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColorectal cancerOncologyCohortMedicineGenotypeInternal medicineDiseaseCancerDemographyBiologyGeneticsGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Colorectal cancer is a significant health concern in the province of Newfoundland and Labrador (NL) which has the highest age-standardized incidence and mortality rates for colorectal cancer in Canada. Several studies have attempted to identify inherited genetic variants which can serve as independent prognostic markers in colorectal cancer patients. We have conducted such a study in two colorectal cancer patient cohorts (discovery and validation sets) from Newfoundland. We investigated 27 genetic polymorphisms in the discovery cohort and attempted to replicate the positive correlations in the validation cohort. Our results showed that the MTHFR _Glu429Ala polymorphism was associated with worse overall survival in two cohorts albeit with an apparently different pattern of inheritance. An association of the heterozygote genotype of this polymorphism with shorter overall survival was also detected in male patients from both cohorts. Another polymorphism, ERCC5_His46His, was also found to be associated with disease-free survival in these cohorts. Further studies on these polymorphisms may facilitate understanding of the mechanisms behind prognostic differences among colorectal cancer patients and aid in better prediction of clinical outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,423
Score d'incertitude au seuil0,851

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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