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Enregistrement W1767571695 · doi:10.1111/j.1558-5646.2012.01622.x

GENETIC SIGNATURE OF ADAPTIVE PEAK SHIFT IN THREESPINE STICKLEBACK

2012· article· en· W1767571695 sur OpenAlexafffund
Sean M. Rogers, Patrick Tamkee, Brian R. Summers, Sarita Balabahadra, Melissa E. Marks, David M. Kingsley, Dolph Schluter

Notice bibliographique

RevueEvolution · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Human Genome Research InstituteHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésGasterosteusSticklebackBiologyEvolutionary biologyPleiotropyPopulationTraitNatural selectionAdaptive evolutionEcologyPhenotypeFish <Actinopterygii>GeneticsGeneFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transition of an evolving population to a new adaptive optimum is predicted to leave a signature in the distribution of effect sizes of fixed mutations. If they affect many traits (are pleiotropic), large effect mutations should contribute more when a population evolves to a farther adaptive peak than to a nearer peak. We tested this prediction in wild threespine stickleback fish (Gasterosteus aculeatus) by comparing the estimated frequency of large effect genetic changes underlying evolution as the same ancestor adapted to two lake types since the end of the ice age. A higher frequency of large effect genetic changes (quantitative trait loci) contributed to adaptive evolution in populations that adapted to lakes representing a more distant optimum than to lakes in which the optimum phenotype was nearer to the ancestral state. Our results also indicate that pleiotropy, not just optimum overshoot, contributes to this difference. These results suggest that a series of adaptive improvements to a new environment leaves a detectable mark in the genome of wild populations. Although not all assumptions of the theory are likely met in natural systems, the prediction may be robust enough to the complexities of natural environments to be useful when forecasting adaptive responses to large environmental changes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,284
Score d'incertitude au seuil0,321

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations94
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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