MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1768690206 · doi:10.1186/ar1455

Identification of a SmD3 epitope with a single symmetrical dimethylation of an arginine residue as a specific target of a subpopulation of anti-Sm antibodies

2004· article· en· W1768690206 sur OpenAlexaff
Michael Mähler, Marvin J. Fritzler, Martin Blüthner

Notice bibliographique

RevueArthritis Research & Therapy · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpitopeArginineResidue (chemistry)AntibodyChemistryIdentification (biology)BiochemistryBiologyImmunologyAmino acidBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Anti-Sm antibodies, identified in 1966 by Tan and Kunkel, are highly specific serological markers for systemic lupus erythrematosus (SLE). Anti-Sm reactivity is found in 5-30% of SLE patients, depending on the autoantibody detection system and the racial background of the SLE population. The Sm autoantigen complex comprises at least nine different polypeptides. All of these core proteins can serve as targets of the anti-Sm B-cell response, but most frequently the B and D polypeptides are involved. Because the BB'Sm proteins share cross-reactive epitopes (PPPGMRPP) with U1 specific ribonucleoproteins, which are more frequently targeted by antibodies that are present in patients with mixed connective tissue disease, the SmD polypeptides are regarded as the Sm autoantigens that are most specific to SLE. It was recently shown that the polypeptides D1, D3 and BB' contain symmetrical dimethylarginine, which is a component of a major autoepitope within the carboxyl-terminus of SmD1. In one of those studies, a synthetic dimethylated peptide of SmD1 (amino acids 95-119) exhibited significantly increased immunoreactivity as compared with unmodified SmD1 peptide. Using immobilized peptides, we confirmed that the dimethylated arginine residues play an essential role in the formation of major SmD1 and SmD3 autoepitopes. Moreover, we demonstrated that one particular peptide of SmD3 represents a more sensitive and more reliable substrate for the detection of a subclass of anti-Sm antibodies. Twenty-eight out of 176 (15.9%) SLE patients but only one out of 449 (0.2%) control individuals tested positive for the anti-SmD3 peptide (SMP) antibodies in a new ELISA system. These data indicate that anti-SMP antibodies are exclusively present in sera from SLE patients. Thus, anti-SMP detection using ELISA represents a new serological marker with which to diagnose and discriminate between systemic autoimmune disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,062
Score d'incertitude au seuil0,446

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations65
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueArthritis Research & TherapyMême sujetCancer-related gene regulationTravaux en français237 207