MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1769855803 · doi:10.1186/s13023-015-0345-3

Novel MASP1 mutations are associated with an expanded phenotype in 3MC1 syndrome

2015· article· en· W1769855803 sur OpenAlexaff
Tahir Atık, Asuman Koparır, Güney Bademci, Joseph Foster, Umut Altunoğlu, Gül Yeşiltepe Mutlu, Sarah Bowdin, Nursel Elçioğlu, Gulsen Akay Tayfun, Sevinç Şahin Atik, Mustafa Özen, Ferda Özkınay, Yasemin Alanay, Hülya Kayserili, Steffen Thiel, Mustafa Tekin

Notice bibliographique

RevueOrphanet Journal of Rare Diseases · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueComplement system in diseases
Établissements canadiensSickKids Foundation
Organismes subventionnairesLeonard M. Miller School of Medicine, University of MiamiNational Institutes of HealthNational Institute on Deafness and Other Communication DisordersLeonard M. Miller School of MedicineEge ÜniversitesiDr. John T. MacDonald FoundationUniversity of Miami
Mots-clésGeneticsMissense mutationBiologyProbandPhenotypeMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: 3MC1 syndrome is a rare autosomal recessive disorder characterized by intellectual disability, short stature and distinct craniofacial, umbilical, and sacral anomalies. Five mutations in MASP1, encoding lectin complement pathway enzymes MASP-1 and MASP-3, have thus far been reported to cause 3MC1 syndrome. Only one previously reported mutation affects both MASP-1 and MASP-3, while the other mutations affect only MASP-3. METHODS: We evaluated six unrelated individuals with 3MC1 syndrome and performed Sanger sequencing for all coding exons of MASP1. We also measured complement lectin and alternative pathway activities in an affected individual's serum. RESULTS: We found two novel splice site mutations, c.1012-2A > G in one and c.891 + 1G > T in two probands, and three novel missense mutations, c.1451G > A (p.G484E), c.1657G > A (p.D553N), and c.1987G > T (p.D663Y). Missense mutations affect only MASP-3, while splice site mutations affect both MASP-1 and MASP-3. In a proband who is homozygous for c.891 + 1G > T, we detected a total lack of lectin complement pathway activity and a 2.5-fold lower alternative pathway activity. The phenotype observed in patients whose both MASP-1 and MASP-3 are affected and in those whose only MASP-3 is affected does not appear to be different. We observed structural brain abnormalities, neonatal tooth, a vascular anomaly and a solid lesion in liver as novel phenotypic features of 3MC1 syndrome. CONCLUSION: Novel mutations and additional phenotypic features expand the genotypic and phenotypic spectrum of 3MC1 syndrome. Although patients with MASP-1 dysfunction in addition to disrupted MASP-3 have an altered complement system, their disease phenotype is not different from those having only MASP-3 dysfunction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueOrphanet Journal of Rare DiseasesMême sujetComplement system in diseasesTravaux en français237 207