Sequence type 1 group B <i>Streptococcus</i> , an emerging cause of invasive disease in adults, evolves by small genetic changes
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Notice bibliographique
Résumé
The molecular mechanisms underlying pathogen emergence in humans is a critical but poorly understood area of microbiologic investigation. Serotype V group B Streptococcus (GBS) was first isolated from humans in 1975, and rates of invasive serotype V GBS disease significantly increased starting in the early 1990s. We found that 210 of 229 serotype V GBS strains (92%) isolated from the bloodstream of nonpregnant adults in the United States and Canada between 1992 and 2013 were multilocus sequence type (ST) 1. Elucidation of the complete genome of a 1992 ST-1 strain revealed that this strain had the highest homology with a GBS strain causing cow mastitis and that the 1992 ST-1 strain differed from serotype V strains isolated in the late 1970s by acquisition of cell surface proteins and antimicrobial resistance determinants. Whole-genome comparison of 202 invasive ST-1 strains detected significant recombination in only eight strains. The remaining 194 strains differed by an average of 97 SNPs. Phylogenetic analysis revealed a temporally dependent mode of genetic diversification consistent with the emergence in the 1990s of ST-1 GBS as major agents of human disease. Thirty-one loci were identified as being under positive selective pressure, and mutations at loci encoding polysaccharide capsule production proteins, regulators of pilus expression, and two-component gene regulatory systems were shown to affect the bacterial phenotype. These data reveal that phenotypic diversity among ST-1 GBS is mainly driven by small genetic changes rather than extensive recombination, thereby extending knowledge into how pathogens adapt to humans.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle