MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1773019924 · doi:10.1002/0471142700.nc0721s59

Steady‐State Kinetic Analysis of DNA Polymerase Single‐Nucleotide Incorporation Products

2014· review· en· W1773019924 sur OpenAlexaff
Derek K. O’Flaherty, F. Peter Guengerich

Notice bibliographique

RevueCurrent Protocols in Nucleic Acid Chemistry · 2014
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensConcordia University
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health Sciences
Mots-clésDNA polymeraseNucleotideDNAPolymerasePrimer extensionPrimer (cosmetics)NucleosideBiochemistryNucleoside triphosphateDNA clampChemistryBiologyMolecular biologyPolymerase chain reactionBiophysicsReverse transcriptaseBase sequenceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This unit describes the experimental procedures for the steady-state kinetic analysis of DNA synthesis across DNA nucleotides (native or modified) by DNA polymerases. In vitro primer extension experiments with a single nucleoside triphosphate species followed by denaturing polyacrylamide gel electrophoresis of the extended products is described. Data analysis procedures and fitting to steady-state kinetic models is presented to highlight the kinetic differences involved in the bypass of damaged versus undamaged DNA. Moreover, explanations concerning problems encountered in these experiments are addressed. This approach provides useful quantitative parameters for the processing of damaged DNA by DNA polymerases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,573
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCurrent Protocols in Nucleic Acid ChemistryMême sujetDNA Repair MechanismsTravaux en français237 207