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Enregistrement W1779066545 · doi:10.1094/pdis-08-15-0846-re

Morphology, Molecular Identity, and Pathogenicity of <i>Verticillium dahliae</i> and <i>V. longisporum</i> Associated with Internally Discolored Horseradish Roots

2015· article· en· W1779066545 sur OpenAlexaboutno aff
Jun Yu, Ibrahim H. Cafarov, M. Babadoost

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyInternal transcribed spacerVerticillium dahliaeVerticilliumBotanyCytochrome c oxidase subunit ICladeSequence analysisGenetic analysisMitochondrial DNAMicrobiologyPhylogeneticsGeneGeneticsRibosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During 2008 to 2009, 255 isolates of Verticillium were obtained from internally discolored horseradish roots collected from California, Illinois, and Ontario. Twenty representative isolates were selected according to morphological features and geographic origin for further characterization. Based on the conidial size, the isolates were divided into two groups: Verticillium dahliae (4.4 ± 1.23 μm) and V. longisporum (7.8 ± 1.76 μm). Genetic diversity of the isolates was determined by sequence analysis of the internal transcribed spacer (ITS) and two mitochondrial genes (cytochrome oxidase subunit III [cox3] and NADH dehydrogenase subunit I [nad1]). Based on ITS analysis, Verticillium isolates were divided into two clades: V. dahliae and V. longisporum. However five isolates of V. longisporum (identified based on conidial size) were clustered with a V. dahliae clade, whereas the other five isolates formed a distinct V. longisporum clade. Combined analysis of the mitochondrial genes cox3 and nad1 showed that the two genetic clades of V. longisporum in ITS region analysis corresponded to the previously reported V. longisporum lineage A1/D3 and A1/D2. Pathogenicity tests revealed that all tested Verticillium isolates caused internal discoloration of horseradish roots, and there were no significant differences in either incidence or severity of root discoloration among the genetic groups.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,530
Score d'incertitude au seuil0,241

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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