Quantitative evaluation of CF airways using HRCT, µCT and histology
Notice bibliographique
Résumé
Aim: To study large and small airway abnormalities in end-stage cystic fibrosis (CF). Methods: 10 CF explant lungs and 6 control (C) lungs were inflated to TLC, frozen at -80°C and scanned using high resolution computed tomography (HRCT) (1 mm slices, max resolution 0.6 mm). Lung tissue cores (1.4 cm x 2 cm) were randomly excised, processed and scanned at a resolution of 8.4 µm using a MicroComputerized Tomography (µCT) device (Skyscan 1172). Using Osirix 4.1 and as previously described (Verleden et al, AJRCCM 2014), we manually assessed the number and size of (visible) open and obstructed airways per generation on HRCT, and the number and size of terminal bronchioles (TB) on µCT. From selected regions in the cores histological sections were sliced. Results: Compared to C, CF had more visible airways on HRCT (567 vs 310; p 0.007). Airway dilatation started from generation 6 (total cumulative airway diameter 203 vs 78cm, p 0.0005). From generation 6 on, around 40% of airways per generation were obstructed. The number of visible airways correlated with the Brody bronchiectasis subscore (R 0.64; p 0.045). In CF versus C, open TB were reduced in number (2.9 vs 5.7/ml; p 0.002) and size (212 vs 363 µm, p 0.004). Closed TB (46%) were fibrotic in 34 or collapsed in 12 % resp. Histology showed narrowed small airways distal to bronchiectasis with disappearance of the lumen and replacement of the airway wall by scar tissue. In 1/5 of studied airways, more distal reorganization into airways with open lumen occurred. Conclusion: End-stage CF causes airway obstruction and dilatation from airway generation 6 on. Distally there is decrease in number and narrowing of TB. Remodeling of small airways was seen on µCT and histology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».