Risk Factors Associated with Bovine Tuberculosis and Molecular Characterization of<i>Mycobacterium bovis</i>Strains in Urban Settings in Niger
Notice bibliographique
Résumé
A retrospective and a longitudinal survey were carried out at the abattoir of Niamey. Results showed a highly significant difference in suspected tuberculosis (TB) gross lesions among different animal species (P < 0.0001). The proportion of carcasses with TB-like lesions was 0.19% among cattle, 0.11% among camels, 0.001% among sheep and 0.0006% among goats. In cattle, cows are significantly more affected than the other categories (P < 0.001). Also in cattle, TB-like lesions are mostly localized in the lungs (92.77%) followed by the lymph nodes (50.87%) and the liver (32.40%). The prevalence of gross lesions compatible with bovine TB (BTB) is strongly influenced by the season (P < 0.0001), is closely correlated with the origin of the animals (P < 0.001) and has a negative impact on the weight of affected animals (P < 0.0001). Sixty-two samples of suspected TB gross lesions were subject to microbiological analysis and molecular typing of strains. Mycobacterium bovis was identified in 18 animals showing five different spoligotypes, belonging to type 'African 1' previously identified in Central and West Africa. In addition, a profile (SB1982) not previously reported distinguished by the absence of spacers 3, 4, 9, 16, 22, 30 and 39-43 has been characterized in this study. To assess risk factors for BTB transmission, a questionnaire on animal husbandry practices, food habits, and clinical signs of TB in animals and humans was submitted to the heads of 1131 randomly selected households. The main risk factors identified are consumption of unpasteurized milk (91%) and lack of hygiene within households (32-74%). Clinical signs that could be attributed to TB were also reported both in humans and in animals of the households.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».