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Enregistrement W1795400617 · doi:10.14670/hh-30.647

Prosaposin: a protein with differential sorting and multiple functions.

2015· review· en· W1795400617 sur OpenAlexaff
Lorena Carvelli, Yang Libin, Carlos R. Morales

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2015
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGolgi apparatusEndoplasmic reticulumCell biologyActivator (genetics)ExtracellularSecretory pathwayBiologyGlycoproteinBiochemistryReceptorChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In eukaryotes the delivery of newly synthesized proteins to their final destination is dependent on a series of functionally distinct compartments, including the endoplasmic reticulum and the Golgi apparatus, which plays a role in post-translational modification, sorting and distribution of proteins. Most cargo is sorted within, and exits from, the trans-Golgi network (TGN). Proteins delivered to lysosomes include hydrolytic enzymes and nonenzymic activator proteins. They are directed away from the cell surface by their binding to mannose-6-phosphate receptors (MPR). However, in I-cell disease, in which the MPR pathway is disrupted, the nonenzymic sphingolipid activator protein, prosaposin, continue to traffic to lysosomes. This observation led to discovery of a new lysosomal sorting receptor, sortilin. The targeting prosaposin to the lysosomes results from the interaction of its C-terminus with sortilin. Deletion of the C-terminus did not interfere with its secretion, but abolished its transport to the lysosomes. Mutational analysis revealed that the first half of the prosaposin C-terminus contains a motif required for its binding to sortilin and its transport to the lysosomes. Prosaposin can be also secreted to the extracellular space as oligomers. Extracellular prosaposin showed to exert a variety of responses in nervous tissues including the activation of G protein-coupled receptors and ERK phosphorylation. Lastly, prosaposin has been found to be expressed in other fluids of the body such as pancreatic juice, bile, cerebrospinal fluid, milk and seminal fluid, indicating that prosaposin is not only a house keeping lysosomal protein but an essential factor in the development and maintenance of the nervous systems and other systems of the body.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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