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Enregistrement W1797900320 · doi:10.1182/blood-2015-05-644039

Prediction of high- and low-risk multiple myeloma based on gene expression and the International Staging System

2015· article· en· W1797900320 sur OpenAlexfundno aff
Rowan Kuiper, Mark van Duin, Martin H. van Vliet, Annemiek Broijl, Bronno van der Holt, Laila el Jarari, Erik H. van Beers, George Mulligan, Hervé Avet‐Loiseau, Walter M. Gregory, Gareth J. Morgan, Hartmut Goldschmidt, Henk M. Lokhorst, Pieter Sonneveld

Notice bibliographique

RevueBlood · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMultiple Myeloma Research and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJanssen PharmaceuticalsBundesministerium für Bildung und ForschungMedical Research CouncilCenter for Translational Molecular MedicineStem Cell NetworkSkylineDxEuropean Hematology Association
Mots-clésMultiple myelomaOncologyInternal medicineMedicineGene expression profilingGene expressionComputational biologyGeneBioinformaticsBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Patients with multiple myeloma have variable survival and require reliable prognostic and predictive scoring systems. Currently, clinical and biological risk markers are used independently. Here, International Staging System (ISS), fluorescence in situ hybridization (FISH) markers, and gene expression (GEP) classifiers were combined to identify novel risk classifications in a discovery/validation setting. We used the datasets of the Dutch-Belgium Hemato-Oncology Group and German-speaking Myeloma Multicenter Group (HO65/GMMG-HD4), University of Arkansas for Medical Sciences-TT2 (UAMS-TT2), UAMS-TT3, Medical Research Council-IX, Assessment of Proteasome Inhibition for Extending Remissions, and Intergroupe Francophone du Myelome (IFM-G) (total number of patients: 4750). Twenty risk markers were evaluated, including t(4;14) and deletion of 17p (FISH), EMC92, and UAMS70 (GEP classifiers), and ISS. The novel risk classifications demonstrated that ISS is a valuable partner to GEP classifiers and FISH. Ranking all novel and existing risk classifications showed that the EMC92-ISS combination is the strongest predictor for overall survival, resulting in a 4-group risk classification. The median survival was 24 months for the highest risk group, 47 and 61 months for the intermediate risk groups, and the median was not reached after 96 months for the lowest risk group. The EMC92-ISS classification is a novel prognostic tool, based on biological and clinical parameters, which is superior to current markers and offers a robust, clinically relevant 4-group model.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations116
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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