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Enregistrement W179797905 · doi:10.1007/978-1-62703-239-1_10

Detection of the Senescence-Associated Secretory Phenotype (SASP)

2012· article· en· W179797905 sur OpenAlexafffund
Françis Rodier

Notice bibliographique

RevueMethods in molecular biology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchInstitut Du Cancer de Montréal
Mots-clésSenescencePhenotypeSecretionParacrine signallingCell biologyBiologyCellCell typeCancer cellCancerGeneticsGeneBiochemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cellular senescence suppresses cancer by eliminating potentially oncogenic cells, participates in tissue repair, contributes to cancer therapy, and promotes organismal aging. Numerous activities of senescent cells depend on the aptitude of these cells to secrete myriads of bioactive molecules, a behavior termed the senescence-associated secretory phenotype (SASP). The SASP supports cell-autonomous functions like the senescence-associated growth arrest, and mediates paracrine interactions between senescent cells and their surrounding microenvironment. The biological functions and the regulation of the SASP are beginning to emerge, and current SASP assessment techniques include the analysis of SASP factors at the mRNA level, the direct measurement of factors inside or outside the cell (i.e., secreted), and the detection of SASP-provoked cellular responses. Here, we focus on a simple approach to collect SASP-conditioned media in order to directly measure secreted SASP factors using sandwich enzyme-linked immunosorbent assay. As an example, we discuss the assessment of the major SASP factor interleukin-6 in senescent human fibroblasts. Supplemental notes are provided to easily adapt this procedure to other SASP factors, change cell types, or scale the techniques for different volumes or high-throughput measurements. These techniques should facilitate the discovery of novel functions and regulators of the SASP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,212
Score d'incertitude au seuil0,401

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,367
Écart entre enseignants0,341 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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