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Enregistrement W1798464304 · doi:10.1002/0471143030.cb2204s23

Fluorescence In Situ Hybridization (<scp>FISH</scp>)

2004· review· en· W1798464304 sur OpenAlexaff
Jane Bayani, Jeremy A. Squire

Notice bibliographique

RevueCurrent Protocols in Cell Biology · 2004
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNick translationHybridization probeMolecular biologyDNAFluorescence in situ hybridizationBiologyIn situ hybridizationMetaphaseDNA–DNA hybridizationCosmidNucleic acid thermodynamicsChromosomeBiochemistryGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fluorescence in situ Hybridization (FISH) involves the preparation of two main components: the DNA probe and the target DNA to which the probe will be hybridized. The DNA probe typically comes from cloned sources such as plasmids, cosmids, PACs, YACs, or BACs; where the insert may contain a specific gene or originate from a specific chromosomal locus. Whole-chromosome paints may also be used but are usually applicable to metaphase preparations. The purified DNA can then be labeled and detected indirectly using haptens, or labeled directly using fluorochrome or dye-conjugated nucleotides. Labeling strategies are also variable, employing standard nick translation or PCR labeling methods. The target DNA can take the form of chromosomes spreads or interphase nuclei. The sources of interphase targets may come from cytogenetic preparations or from paraffin-embedded tissues. Both the labeled DNA probe and DNA target are denatured to a single-stranded state and permitted to hybridize to each other. Post-hybridization washes and fluorescently-labeled antibody incubations follow the 24-hour hybridization, and the specimen is ready for visualization by fluorescent microscopy. Successful interpretation of FISH experiments is dependent on the quality of the starting materials, hybridization efficiencies, and stringency of post-hybridization washes and antibody detections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,010

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations125
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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