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Enregistrement W1799953022 · doi:10.3233/jad-142886

Correcting for the Absence of a Gold Standard Improves Diagnostic Accuracy of Biomarkers in Alzheimer’s Disease

2015· article· en· W1799953022 sur OpenAlexfundno aff
Els Coart, Leandro García Barrado, Flora H. Duits, Philip Scheltens, Wiesje M. van der Flier, Charlotte E. Teunissen, Saskia M. van der Vies, Tomasz Burzykowski

Notice bibliographique

RevueJournal of Alzheimer s Disease · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthVrije Universiteit AmsterdamGenentechIXICOServierPfizerBioClinicaBiogenAlzheimer NederlandEisaiStichting DioraphteVanderbilt University Medical CenterNorthern California Institute for Research and EducationSynarcUniversity of Southern CaliforniaMedpaceU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbUniversity of California, San DiegoNovartis Pharmaceuticals CorporationMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's Association
Mots-clésGold standard (test)DiseaseDiagnostic accuracyAlzheimer's diseaseMedicineComputer scienceInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Studies investigating the diagnostic accuracy of biomarkers for Alzheimer's disease (AD) are typically performed using the clinical diagnosis or amyloid-β positron emission tomography as the reference test. However, neither can be considered a gold standard or a perfect reference test for AD. Not accounting for errors in the reference test is known to cause bias in the diagnostic accuracy of biomarkers. OBJECTIVE: To determine the diagnostic accuracy of AD biomarkers while taking the imperfectness of the reference test into account. METHODS: To determine the diagnostic accuracy of AD biomarkers and taking the imperfectness of the reference test into account, we have developed a Bayesian method. This method establishes the biomarkers' true value in predicting the AD-pathology status by combining the reference test and the biomarker data with available information on the reliability of the reference test. The new methodology was applied to two clinical datasets to establish the joint accuracy of three cerebrospinal fluid biomarkers (amyloid-β 1 - 42, Total tau, and P-tau181p) by including the clinical diagnosis as imperfect reference test into the analysis. RESULTS: The area under the receiver-operating-characteristics curve to discriminate between AD and controls, increases from 0.949 (with 95% credible interval [0.935,0.960]) to 0.990 ([0.985,0.995]) and from 0.870 ([0.817,0.912]) to 0.975 ([0.943,0.990]) for the cohorts, respectively. CONCLUSIONS: Use of the Bayesian methodology enables an improved estimate of the exact diagnostic value of AD biomarkers and overcomes the lack of a gold standard for AD. Using the new method will increase the diagnostic confidence for early stages of AD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,054
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,155
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,946
Score d'incertitude au seuil0,288

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0540,155
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,363
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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