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Enregistrement W1800064185 · doi:10.1139/g10-067

Molecular genetic characterization of<i>Drosophila</i>ATM conserved functional domains

2010· article· en· W1800064185 sur OpenAlexafffundvenue
Mikael Pedersen, Stanley Tiong, Shelagh D. Campbell

Notice bibliographique

RevueGenome · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesDirectorate for Biological SciencesUniversity of Alberta
Mots-clésBiologyGeneticsTelomereDNA repairDrosophila melanogasterAtaxia-telangiectasiaDNA damageGeneProtein kinase domainMutationDNAMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ATM-related kinases promote repair of DNA double-strand breaks and maintenance of chromosome telomeres, functions that are essential for chromosome structural integrity in all eukaryotic organisms. In humans, loss of ATM function is associated with ataxia telangiectasia, a neurodegenerative disease characterized by extreme sensitivity to DNA damage. Drosophila melanogaster has recently emerged as a useful animal model for analyzing the molecular functions of specific domains of this large, multifunctional kinase. The gene encoding Drosophila ATM kinase (dATM) was originally designated tefu because of the telomere fusion defects observed in atm mutants. In this report, molecular characterization of eight atm (tefu) alleles identified nonsense mutations predicted to truncate conserved C-terminal domains of the dATM protein, as well as two interesting missense mutations. One of these missense mutations localized within a putative HEAT repeat in the poorly characterized N-terminal domain of dATM (atm4), whereas another associated with a temperature-sensitive allele (atm8) changed the last amino acid of the conserved FATC domain. Leveraging this molecular information with the powerful genetic tools available in Drosophila should facilitate future analysis of conserved ATM-mediated molecular mechanisms that are important for telomere maintenance, DNA repair, and neurodegeneration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2010
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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