Endoplasmic Protein Nogo-B (RTN4-B) Interacts with GRAMD4 and Regulates TLR9-Mediated Innate Immune Responses
Notice bibliographique
Résumé
TLRs are distributed in their characteristic cellular or subcellular compartments to efficiently recognize specific ligands and to initiate intracellular signaling. Whereas TLRs recognizing pathogen-associated lipids or proteins are localized to the cell surface, nucleic acid-sensing TLRs are expressed in endosomes and lysosomes. Several endoplasmic reticulum (ER)-resident proteins are known to regulate the trafficking of TLRs to the specific cellular compartments, thus playing important roles in the initiation of innate immune responses. In this study, we show that an ER-resident protein, Nogo-B (or RTN4-B), is necessary for immune responses triggered by nucleic acid-sensing TLRs, and that a newly identified Nogo-B-binding protein (glucosyltransferases, Rab-like GTPase activators and myotubularins [GRAM] domain containing 4 [GRAMD4]) negatively regulates the responses. Production of inflammatory cytokines in vitro by macrophages stimulated with CpG-B oligonucleotides or polyinosinic:polycytidylic acid was attenuated in the absence of Nogo-B, which was also confirmed in serum samples from Nogo-deficient mice injected with polyinosinic:polycytidylic acid. Although a deficiency of Nogo-B did not change the incorporation or delivery of CpG to endosomes, the localization of TLR9 to endolysosomes was found to be impaired. We identified GRAMD4 as a downmodulator for TLR9 response with a Nogo-B binding ability in ER, because our knockdown and overexpression experiments indicated that GRAMD4 suppresses the TLR9 response and knockdown of Gramd4 strongly enhanced the response in the absence of Nogo-B. Our findings indicate a critical role of Nogo-B and GRAMD4 in trafficking of TLR9.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».