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Enregistrement W1801258811

Polymorphisms in the tumour necrosis factor alpha-induced protein 3 (TNFAIP3) gene are associated with chronic rhinosinusitis.

2009· article· en· W1801258811 sur OpenAlexaff
Chantale Cormier, Yohan Bossé, Leandra Endam Mfuna, Thomas J. Hudson, Martin Desrosiers

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineHealth Professions
ThématiquePediatric health and respiratory diseases
Établissements canadiensHôtel-Dieu de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismProinflammatory cytokineTumor necrosis factor alphaImmunologyChronic rhinosinusitisGenePathogenesisMedicinePopulationBiologyGeneticsBioinformaticsGenotypeInflammation
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Factors conferring susceptibility to chronic rhinosinusitis remain unknown. However, advances in genomics offer powerful tools to explore this disorder. Tumour necrosis factor (TNF) is a crucial proinflammatory cytokine that exerts inflammatory and immunomodulatory activities important in host defense. Our objective was to determine whether polymorphisms in genes in the TNF superfamily (TNF, TNF-alpha-induced protein 3, TNF-alpha-induced protein 6) were associated with chronic rhinosinusitis. METHODS: Deoxyribonucleic acid (DNA) extracted from a population of 206 patients with severe chronic rhinosinusitis and 196 postal code-matched controls was used. Three candidate genes related to the TNF inflammatory pathway were assessed. For each gene, an informative set of single nucleotide polymorphisms was genotyped. RESULTS: Thirty-five single nucleotide polymorphisms were genotyped. Two polymorphisms located within the TNF-alpha-induced protein 3 gene (TNFAIP3) reached the nominal p value threshold (p < .05) for association with chronic rhinosinusitis. However, none of these polymorphisms resist multiple testing adjustments. CONCLUSIONS: Our data suggest that two polymorphisms in TNFAIP3 are weakly associated with severe chronic rhinosinusitis but do not support an association with genetic variants in TNF or TNF-alpha-induced protein 6. Although these results do not support correction for multiple testing and have to be validated in a second population, they nevertheless suggest that further studies of the role of TNFAIP3 in the pathogenesis of disease are warranted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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