Polymorphisms in the tumour necrosis factor alpha-induced protein 3 (TNFAIP3) gene are associated with chronic rhinosinusitis.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Factors conferring susceptibility to chronic rhinosinusitis remain unknown. However, advances in genomics offer powerful tools to explore this disorder. Tumour necrosis factor (TNF) is a crucial proinflammatory cytokine that exerts inflammatory and immunomodulatory activities important in host defense. Our objective was to determine whether polymorphisms in genes in the TNF superfamily (TNF, TNF-alpha-induced protein 3, TNF-alpha-induced protein 6) were associated with chronic rhinosinusitis. METHODS: Deoxyribonucleic acid (DNA) extracted from a population of 206 patients with severe chronic rhinosinusitis and 196 postal code-matched controls was used. Three candidate genes related to the TNF inflammatory pathway were assessed. For each gene, an informative set of single nucleotide polymorphisms was genotyped. RESULTS: Thirty-five single nucleotide polymorphisms were genotyped. Two polymorphisms located within the TNF-alpha-induced protein 3 gene (TNFAIP3) reached the nominal p value threshold (p < .05) for association with chronic rhinosinusitis. However, none of these polymorphisms resist multiple testing adjustments. CONCLUSIONS: Our data suggest that two polymorphisms in TNFAIP3 are weakly associated with severe chronic rhinosinusitis but do not support an association with genetic variants in TNF or TNF-alpha-induced protein 6. Although these results do not support correction for multiple testing and have to be validated in a second population, they nevertheless suggest that further studies of the role of TNFAIP3 in the pathogenesis of disease are warranted.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».