Automated Video-Based Analysis of Contractility and Calcium Flux in Human-Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes Cultured over Different Spatial Scales

2014· article· en· 333 citations· W1802031919 sur OpenAlex· 10.1089/ten.tec.2014.0283

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,029

Tête enseignante GPT0,346

Écart entre enseignants: 0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation: score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

Contractile motion is the simplest metric of cardiomyocyte health in vitro, but unbiased quantification is challenging. We describe a rapid automated method, requiring only standard video microscopy, to analyze the contractility of human-induced pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes (iPS-CM). New algorithms for generating and filtering motion vectors combined with a newly developed isogenic iPSC line harboring genetically encoded calcium indicator, GCaMP6f, allow simultaneous user-independent measurement and analysis of the coupling between calcium flux and contractility. The relative performance of these algorithms, in terms of improving signal to noise, was tested. Applying these algorithms allowed analysis of contractility in iPS-CM cultured over multiple spatial scales from single cells to three-dimensional constructs. This open source software was validated with analysis of isoproterenol response in these cells, and can be applied in future studies comparing the drug responsiveness of iPS-CM cultured in different microenvironments in the context of tissue engineering.

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La notice

Revue: Tissue Engineering Part C Methods
Thématique: 3D Printing in Biomedical Research
Domaine: Engineering
Établissements canadiens: —
Organismes subventionnaires: National Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of General Medical SciencesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteGladstone InstitutesDeutsche ForschungsgemeinschaftHoward Hughes Medical Institute
Mots-clés: ContractilityInduced pluripotent stem cellContext (archaeology)Cell biologyComputer scienceCalciumBiologyBiomedical engineeringBiological systemComputational biologyChemistryEngineeringGeneticsEmbryonic stem cellEndocrinology
Résumé présent dans OpenAlex: oui
API: /api/v1/works/W1802031919