A widely conserved molecular switch controls quorum sensing and symbiosis island transfer in <i><scp>M</scp>esorhizobium loti</i> through expression of a novel antiactivator
Notice bibliographique
Résumé
ICEMlSym(R7A) of Mesorhizobium loti is an integrative and conjugative element (ICE) that confers the ability to form a nitrogen-fixing symbiosis with Lotus species. Horizontal transfer is activated by TraR and N-acyl-homoserine lactone (AHL), which can stimulate ICE excision in 100% of cells. However, in wild-type cultures, the ICE is excised at low frequency. Here we show that QseM, a widely conserved ICE-encoded protein, is an antiactivator of TraR. Mutation of qseM resulted in TraR-dependent activation of AHL production and excision, but did not affect transcription of traR. QseM and TraR directly interacted in a bacterial two-hybrid assay in the presence of AHL. qseM expression was repressed by a DNA-binding protein QseC, which also activated qseC expression from a leaderless transcript. QseC differentially bound two adjacent operator sites, the lower affinity of which overlapped the -35 regions of the divergent qseC-qseM promoters. QseC homologues were identified on ICEs, TraR/TraM-regulated plasmids and restriction-modification cassettes, suggesting a conserved mode of regulation. Six QseC variants with distinct operators were identified that showed evidence of reassortment between mobile elements. We propose that QseC and QseM comprise a bimodal switch that restricts quorum sensing and ICEMlSym(R7A) transfer to a small proportion of cells in the population.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».