MOLECULAR CHARACTERIZATION OF POTYVIRUSES INFECTING POTATO AND VEGETABLES IN IRAQ
Notice bibliographique
Résumé
The genetic diversity of potyviruses infecting potato and vegetables in Iraq was determined by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) targeting the 3´ terminal part of the genome. RT-PCR products were cloned and sequenced. Sequence analysis confirmed the occurrence of potyviruses, namely Bean yellow mosaic virus (BYMV) in broad bean, Potato virus Y (PVY) in potato and tomato, and Zucchini yellow mosaic virus (ZYMV) in zucchini squash. BYMV sequences showed maximum nucleotide sequence identity (97.2-98.7%) with isolates from Australia and Japan. Most PVY sequences were very closely related (ca. 99% nucleotide sequence identity) to PVYO: N isolates from USA and Canada, whereas other sequences showed nucleotide identities (98.5-98.7%) with PVYNTN isolates from Poland, UK and Syria. ZYMV sequences showed maximum nucleotide identity (97.9%) with an isolate from Israel. The low genetic diversity amongst Iraqi potyviruses, alongside their high sequence identities with potyviruses from other countries, suggests a relatively recent introduction to Iraq through imported planting materials.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».