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Enregistrement W1805154234 · doi:10.1186/s40478-015-0231-1

Transcriptional profiling of differentially vulnerable motor neurons at pre-symptomatic stage in the Smn 2b/- mouse model of spinal muscular atrophy

2015· article· en· W1805154234 sur OpenAlexafffund
Lyndsay M. Murray, Ariane Beauvais, Sabrina Gibeault, Natalie L. Courtney, Rashmi Kothary

Notice bibliographique

RevueActa Neuropathologica Communications · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesStrongCanadian Institutes of Health ResearchCure SMAMuscular Dystrophy Association
Mots-clésMotor neuronSMN1Spinal muscular atrophyNeuroscienceBiologyAtrophyNeuromuscular junctionMotor unitSpinal cordGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: The term motor neuron disease encompasses a spectrum of disorders in which motor neurons are the lost. Importantly, while some motor neurons are lost early in disease and others remain intact at disease end-stage. This creates a valuable experimental paradigm to investigate the factors that regulate motor neuron vulnerability. Spinal muscular atrophy is a childhood motor neuron disease caused by mutations or deletions in the SMN1 gene. Here, we have performed transcriptional analysis on differentially vulnerable motor neurons from an intermediate mouse model of Spinal muscular atrophy at a presymptomatic time point. RESULTS: We have characterised two differentially vulnerable populations, differing in the level neuromuscular junction loss. Transcriptional analysis on motor neuron cell bodies revealed that reduced Smn levels correlate with a reduction of transcripts associated with the ribosome, rRNA binding, ubiquitination and oxidative phosphorylation. Furthermore, P53 pathway activation precedes neuromuscular junction loss, suggesting that denervation may be a consequence, rather than a cause of motor neuron death in Spinal muscular atrophy. Finally, increased vulnerability correlates with a decrease in the positive regulation of DNA repair. CONCLUSIONS: This study identifies pathways related to the function of Smn and associated with differential motor unit vulnerability, thus presenting a number of exciting targets for future therapeutic development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,111
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations83
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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