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Enregistrement W1807019775 · doi:10.1002/art.38888

Vimentin Is a Dominant Target of In Situ Humoral Immunity in Human Lupus Tubulointerstitial Nephritis

2014· article· en· W1807019775 sur OpenAlexafffund
Anthony Chang, Kichul Ko, Carole J. Henry Dunand, Scott Henderson, Mark Maienschein‐Cline, Natalya Kaverina, Brad H. Rovin, Marlene Salgado Ferrer, Don Wolfgeher, Vladimir M. Liarski, D. James Haddon, Paul J. Utz, Patrick C. Wilson, Marcus R. Clark

Notice bibliographique

RevueArthritis & Rheumatology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSystemic Lupus Erythematosus Research
Établissements canadiensCanadian Institutes of Health Research
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésLupus nephritisImmunologyHumoral immunityVimentinIn situMedicineImmunityImmune systemBiologyPathologyImmunohistochemistryChemistryDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: In lupus nephritis (LN), severe tubulointerstitial inflammation (TII) predicts progression to renal failure. Severe TII is associated with tertiary lymphoid neogenesis and in situ antigen-driven clonal B cell selection. The autoantigen(s) driving in situ B cell selection in TII are not known. This study was undertaken to identify the dominant driving autoantigen(s). METHODS: Single CD38+ or Ki-67+ B cells were laser captured from 7 biopsy specimens that were diagnostic for LN. Eighteen clonally expanded immunoglobulin heavy- and light-chain variable region pairs were cloned and expressed as monoclonal antibodies. Seven more antibodies were cloned from flow-sorted CD38+ cells from an eighth biopsy specimen. Antigen characterization was performed using a combination of confocal microscopy, enzyme-linked immunosorbent assay, screening protoarrays, immunoprecipitation, and mass spectrometry. Serum IgG titers to the dominant antigen in 48 LN and 35 non-nephritic lupus samples were determined using purified antigen-coated arrays. Autoantigen expression on normal and LN kidney was localized by immunohistochemistry and immunofluorescence. RESULTS: Eleven of 25 antibodies reacted with cytoplasmic structures, 4 reacted with nuclei, and none reacted with double-stranded DNA. Vimentin was the only autoantigen identified by both mass spectrometry and protoarray. Ten of the 11 anticytoplasmic TII antibodies directly bound vimentin. Vimentin was highly expressed by tubulointerstitial inflammatory cells, and the TII antibodies tested preferentially bound inflamed tubulointerstitium. Finally, high titers of serum antivimentin antibodies were associated with severe TII (P = 0.0001). CONCLUSION: Vimentin, an antigenic feature of inflammation, is a dominant autoantigen targeted in situ in LN TII. This adaptive autoimmune response likely feeds forward to worsen TII and renal damage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,760
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations99
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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