Molecular identification of endangered Korean lady’s slipper orchids (<i>Cypripedium</i>, Orchidaceae) and related taxa
Notice bibliographique
Résumé
Reliable and accurate species identification is essential to establish a strategy for monitoring and manipulation of plant populations for conservation biology. However, identification of nonflowering plants is difficult. Based on recent advances in molecular biological techniques, various molecular identification methodologies have been proposed and applied in plant science, with a focus on medicinally valuable species. Lady’s slipper orchids (Cypripedium) are a representative terrestrial orchid group that includes many endangered species. Of 46 species, 3 (Cypripedium japonicum Thunb., Cypripedium macranthos Sw., and Cypripedium guttatum var. koreanum Nakai) were reported from Korea and categorised as endangered species or at risk of becoming endangered because of the rapidly decreasing population. We generated an accurate molecular identification system for these species using the sequence variation and species-specific SNPs of two plastid loci, rpoC2 and the IGS region between atpF and atpH. We selected the atpF-H region for molecular identification of the Korean Cypripedium and related Taiwan-endemic taxon Cypripedium formosanum Hayata. Cypripedium guttatum var. koreanum contained large deletions of over 300 bp, and could be distinguished by electrophoresis. For the other three species, we designed new primers based on a specific insertion (C. macranthos) and SNPs (C. japonicum and C. formosanum). We confirmed that molecular identification enables detection of each species using species-specific primers.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».