Characterization of a copper-transport operon, copYAZ, from Streptococcus mutans The GenBank accession number for the cop operon sequence reported in this paper is AF296446.
Notice bibliographique
Résumé
A copper-transport (copYAZ) operon was cloned from the oral bacterium Streptococcus mutans JH1005. DNA sequencing showed that the operon contained three genes (copY, copA and copZ), which were flanked by a single promoter and a factor-independent terminator. copY encoded a small protein of 147 aa with a heavy-metal-binding motif (CXCX(4)CXC) at the C-terminus. CopY shared extensive homology with other bacterial negative transcriptional regulators. copA encoded a 742 aa protein that shared extensive homology with P-type ATPases. copZ encoded a 67 aa protein that also contained a heavy-metal-binding motif (CXXC) at the N-terminus. Northern blotting showed that a 3.2 kb transcript was produced by Cu2+-induced Strep. mutans cells, suggesting that the genes were synthesized as a polycistronic message. The transcriptional start site of the cop operon was mapped and shown to lie within the inverted repeats of the promoter-operator region. Strep. mutans wild-type cells were resistant to 800 microM Cu2+, whereas cells of a cop knock-out mutant were killed by 200 microM Cu2+. Complementation of the cop knock-out mutant with the cop operon restored Cu2+ resistance to wild-type level. The wild-type and the mutant did not show any differences in susceptibility to other heavy metals, suggesting that the operon was specific for copper. By using a chloramphenicol acetyltransferase reporter gene fusion, the cop operon was shown to be negatively regulated by CopY and could be derepressed by Cu2+.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».