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Enregistrement W1821123847 · doi:10.1104/pp.110.169045

Target of Rapamycin Regulates Development and Ribosomal RNA Expression through Kinase Domain in Arabidopsis  

2011· article· en· W1821123847 sur OpenAlexaff
Maozhi Ren, Shuqing Qiu, Prakash Venglat, Daoquan Xiang, Li Feng, Gopalan Selvaraj, Raju Datla

Notice bibliographique

RevuePLANT PHYSIOLOGY · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePI3K/AKT/mTOR signaling in cancer
Établissements canadiensPlant Biotechnology Institute
Organismes subventionnairesArizona Biomedical Research Commission
Mots-clésBiologyRibosome biogenesisArabidopsisProtein kinase domainCell biologyGeneticsNuclear localization sequenceMutantGeneRNARibosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Target of rapamycin (TOR) is a central regulator of cell growth, cell death, nutrition, starvation, hormone, and stress responses in diverse eukaryotes. However, very little is known about TOR signaling and the associated functional domains in plants. We have taken a genetic approach to dissect TOR functions in Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) and report here that the kinase domain is essential for the role of TOR in embryogenesis and 45S rRNA expression. Twelve new T-DNA insertion mutants, spanning 14.2 kb of TOR-encoding genomic region, have been characterized. Nine of these share expression of defective kinase domain and embryo arrest at 16 to 32 cell stage. However, three T-DNA insertion lines affecting FATC domain displayed normal embryo development, indicating that FATC domain was dispensable in Arabidopsis. Genetic complementation showed that the TOR kinase domain alone in tor-10/tor-10 mutant background can rescue early embryo lethality and restore normal development. Overexpression of full-length TOR or kinase domain in Arabidopsis displayed developmental abnormalities in meristem, leaf, root, stem, flowering time, and senescence. We further show that TOR, especially the kinase domain, plays a role in ribosome biogenesis by activating 45S rRNA production. Of the six putative nuclear localization sequences in the kinase domain, nuclear localization sequence 6 was identified to confer TOR nuclear targeting in transient expression assays. Chromatin immunoprecipitation studies revealed that the HEAT repeat domain binds to 45S rRNA promoter and the 5' external transcribed spacer elements motif. Together, these results show that TOR controls the embryogenesis, postembryonic development, and 45S rRNA production through its kinase domain in Arabidopsis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,535

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations173
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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