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Enregistrement W1822512648 · doi:10.1523/jneurosci.21-04-01169.2001

Rocker Is a New Variant of the Voltage-Dependent Calcium Channel Gene<i>Cacna1a</i>

2001· article· en· W1822512648 sur OpenAlexaff
Theresa A. Zwingman, Paul E. Neumann, Jeffrey L. Noebels, Karl Herrup

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroscience · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Mental HealthMedical Research CouncilNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyLocus (genetics)GeneticsAlleleMutantLocus coeruleusGeneNeuroscienceNucleus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rocker (gene symbol rkr), a new neurological mutant phenotype, was found in descendents of a chemically mutagenized male mouse. Mutant mice display an ataxic, unstable gait accompanied by an intention tremor, typical of cerebellar dysfunction. These mice are fertile and appear to have a normal life span. Segregation analysis reveals rocker to be an autosomal recessive trait. The overall cytoarchitecture of the young adult brain appears normal, including its gross cerebellar morphology. Golgi-Cox staining, however, reveals dendritic abnormalities in the mature cerebellar cortex characterized by a reduction of branching in the Purkinje cell dendritic arbor and a "weeping willow" appearance of the secondary branches. Using simple sequence length polymorphism markers, the rocker locus was mapped to mouse chromosome 8 within 2 centimorgans of the calcium channel alpha1a subunit (Cacna1a, formerly known as tottering) locus. Complementation tests with the leaner mutant allele (Cacna1a(la)) produced mutant animals, thus identifying rocker as a new allele of Cacna1a (Cacna1a(rkr)). Sequence analysis of the cDNA revealed rocker to be a point mutation resulting in an amino acid exchange: T1310K between transmembrane regions 5 and 6 in the third homologous domain. Important distinctions between rocker and the previously characterized alleles of this locus include the absence of aberrant tyrosine hydroxylase expression in Purkinje cells and the separation of the absence seizures (spike/wave type discharges) from the paroxysmal dyskinesia phenotype. Overall these findings point to an important dissociation between the seizure phenotypes and the abnormalities in catecholamine metabolism, and they emphasize the value of allelic series in the study of gene function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations153
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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