Mutually exclusive Th2 and Th17 bronchial gene expression signatures are associated with eosinophilia in asthma
Notice bibliographique
Résumé
*JA and PB are co-senior authors Background: Th2 and Th17 cytokine-dependent inflammatory pathways are potential therapeutic targets in severe asthma. The extent of the activity of these two pathways in individual patients is unclear. Objective: To develop gene expression signatures of Th2 and Th17 cytokine activity in asthmatic airways and assess their relationships to airway pathophysiology, clinical disease expression, and biomarkers of cytokine activity. Methods: Th2 and Th17 cytokine gene expression metrics were developed in vitro in primary human bronchial epithelial cells and used to interrogate the activity of these pathways in endobronchial tissue from patients with clinically well-characterised asthma across a spectrum of severity (n=51). Results: We identified three clusters of cytokine gene expression in asthmatic airways: Th2-high, Th17-high and Th2/17-low. Th2-high and Th17-high patterns were mutually exclusive in individual patients, and were inversely correlated. However Th2 and Th17 signatures were both associated with airway eosinophilia. The Th17 signature was only detected in patients taking inhaled corticosteroids (ICS) while Th2-high and Th2/17-low patterns were present in ICS users and non-users. Only the Th2/17-low signature was associated with non-eosinophilic pathology. Conclusion: Patients with severe asthma may have either a Th2-high, Th17-high or Th2/17-low pattern of airway gene expression. Low levels of blood and sputum eosinophilia predict a Th2/17-low molecular phenotype, but all three molecular phenotypes may be associated with eosinophilic disease, which may have implications for therapeutic strategies targeting inflammatory cytokines.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».