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Enregistrement W1823244793 · doi:10.1186/1471-2350-7-41

Eight previously unidentified mutations found in the OA1ocular albinism gene

2006· article· en· W1823244793 sur OpenAlexaff
Hélène Mayeur, Olivier Roche, Christelle Vêtu, Carolina O. Jaliffa, Dominique Marchant, Hélène Dollfus, Dominique Bonneau, Francis L. Munier, Daniel F. Schorderet, Alex V. Levin, Elise Héon, Joanne Sutherland, Didier Lacombe, Edith Said, Eedy Mezer, Josseline Kaplan, Jean‐Louis Dufier, C. Marsac, M Ménasche, Marc Abitbol

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Genetics · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquemelanin and skin pigmentation
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesCentre National de la Recherche ScientifiqueFondation de FranceFondation pour la Recherche MédicaleInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleFondation de l'Avenir pour la Recherche Médicale Appliquée
Mots-clésBiologyGeneticsExonGeneMutationGene duplicationFrameshift mutationMolecular biologyStop codonAlbinismOculocutaneous albinismgenomic DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Ocular albinism type 1 (OA1) is an X-linked ocular disorder characterized by a severe reduction in visual acuity, nystagmus, hypopigmentation of the retinal pigmented epithelium, foveal hypoplasia, macromelanosomes in pigmented skin and eye cells, and misrouting of the optical tracts. This disease is primarily caused by mutations in the OA1 gene. METHODS: The ophthalmologic phenotype of the patients and their family members was characterized. We screened for mutations in the OA1 gene by direct sequencing of the nine PCR-amplified exons, and for genomic deletions by PCR-amplification of large DNA fragments. RESULTS: We sequenced the nine exons of the OA1 gene in 72 individuals and found ten different mutations in seven unrelated families and three sporadic cases. The ten mutations include an amino acid substitution and a premature stop codon previously reported by our team, and eight previously unidentified mutations: three amino acid substitutions, a duplication, a deletion, an insertion and two splice-site mutations. The use of a novel Taq polymerase enabled us to amplify large genomic fragments covering the OA1 gene. and to detect very likely six distinct large deletions. Furthermore, we were able to confirm that there was no deletion in twenty one patients where no mutation had been found. CONCLUSION: The identified mutations affect highly conserved amino acids, cause frameshifts or alternative splicing, thus affecting folding of the OA1 G protein coupled receptor, interactions of OA1 with its G protein and/or binding with its ligand.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,298
Score d'incertitude au seuil0,377

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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