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Enregistrement W1824190268 · doi:10.5539/jfr.v4n5p51

Transcriptomic Response of Salmonella Typhimurium Heat Shock Gene Expression Under Thermal Stress at 48 °C

2015· article· en· W1824190268 sur OpenAlexvenueno aff
Sujata A. Sirsat, Christopher A. Baker, Si Hong Park, Arunachalam Muthaiyan, Scot E. Dowd, Steven C. Ricke

Notice bibliographique

RevueJournal of Food Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueListeria monocytogenes in Food Safety
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSalmonella entericaSalmonellaHeat shock proteinTranscriptomeVirulenceHeat shockMicrobiologyGeneQuorum sensingBiologyGene expressionBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<em>Salmonella enterica</em> has been associated with a variety of food products, and thermal treatments are commonly used to reduce or eliminate pathogens from these foods. While the physiological response of <em>Salmonella</em> to a wide range of lethal and sublethal heating temperatures has been examined, only limited information is available at the transcriptional level. The objective of this study was to investigate the transcriptional profile of <em>Salmonella</em> Typhimurium when subjected to thermal shock at 48 °C (10 min). Transcriptomic analysis was performed using partial microarrays (1152 genes) consisting of quorum sensing, virulence, membrane, and stress related genes. Apparent <em>Salmonella</em> viability based on the optical density decreased in response to thermal exposure. Transcriptomic analysis revealed induction of several heat shock and stress related genes due to thermal exposure at 48 °C. This research reveals that there is an impact of exposure to a sublethal temperature (48°C) on the subsequent transcriptional responses of <em>S.</em> Typhimurium.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,524

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,182
Tête enseignante GPT0,394
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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