MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1826261315 · doi:10.1371/journal.pone.0138421

Toxicogenomic Screening of Replacements for Di(2-Ethylhexyl) Phthalate (DEHP) Using the Immortalized TM4 Sertoli Cell Line

2015· article· en· W1826261315 sur OpenAlexafffund
Thomas Nardelli, Hanno C. Erythropel, Bernard Robaire

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEffects and risks of endocrine disrupting chemicals
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesInstitute of Human Development, Child and Youth HealthFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésPhthalateChemistryDibutyl phthalateDownregulation and upregulationMAPK/ERK pathwayPlasticizerSignal transductionBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phthalate plasticizers such as di(2-ethylhexyl) phthalate (DEHP) are being phased out of many consumer products because of their endocrine disrupting properties and their ubiquitous presence in the environment. The concerns raised from the use of phthalates have prompted consumers, government, and industry to find alternative plasticizers that are safe, biodegradable, and have the versatility for multiple commercial applications. We examined the toxicogenomic profile of mono(2-ethylhexyl) phthalate (MEHP, the active metabolite of DEHP), the commercial plasticizer diisononyl cyclohexane-1,2-dicarboxylate (DINCH), and three recently proposed plasticizers: 1,4-butanediol dibenzoate (BDB), dioctyl succinate (DOS), and dioctyl maleate (DOM), using the immortalized TM4 Sertoli cell line. Results of gene expression studies revealed that DOS and BDB clustered with control samples while MEHP, DINCH and DOM were distributed far away from the control-DOS-BDB cluster, as determined by principle component analysis. While no significant changes in gene expression were found after treatment with BDB and DOS, treatment with MEHP, DINCH and DOM resulted in many differentially expressed genes. MEHP upregulated genes downstream of PPAR and targeted pathways of cholesterol biosynthesis without modulating the expression of PPAR's themselves. DOM upregulated genes involved in glutathione stress response, DNA repair, and cholesterol biosynthesis. Treatment with DINCH resulted in altered expression of a large number of genes involved in major signal transduction pathways including ERK/MAPK and Rho signalling. These data suggest DOS and BDB may be safer alternatives to DEHP/MEHP than DOM or the commercial alternative DINCH.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,107
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetEffects and risks of endocrine disrupting chemicalsTravaux en français237 207