Reduced sodium/proton exchanger NHE3 activity causes congenital sodium diarrhea
Notice bibliographique
Résumé
Congenital sodium diarrhea (CSD) refers to an intractable diarrhea of intrauterine onset with high fecal sodium loss. CSD is clinically and genetically heterogeneous. Syndromic CSD is caused by SPINT2 mutations. While we recently described four cases of the non-syndromic form of CSD that were caused by dominant activating mutations in intestinal receptor guanylate cyclase C (GC-C), the genetic cause for the majority of CSD is still unknown. Therefore, we aimed to determine the genetic cause for non-GC-C non-syndromic CSD in 18 patients from 16 unrelated families applying whole-exome sequencing and/or chromosomal microarray analyses and/or direct Sanger sequencing. SLC9A3 missense, splicing and truncation mutations, including an instance of uniparental disomy, and whole-gene deletion were identified in nine patients from eight families with CSD. Two of these nine patients developed inflammatory bowel disease (IBD) at 4 and 16 years of age. SLC9A3 encodes Na(+)/H(+) antiporter 3 (NHE3), which is the major intestinal brush-border Na(+)/H(+) exchanger. All mutations were in the NHE3 N-terminal transport domain, and all missense mutations were in the putative membrane-spanning domains. Identified SLC9A3 missense mutations were functionally characterized in plasma membrane NHE null fibroblasts. SLC9A3 missense mutations compromised NHE3 activity by reducing basal surface expression and/or loss of basal transport function of NHE3 molecules, whereas acute regulation was normal. This study identifies recessive mutations in NHE3, a downstream target of GC-C, as a cause of CSD and implies primary basal NHE3 malfunction as a predisposition for IBD in a subset of patients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».