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Enregistrement W1827919153 · doi:10.5858/arpa.2015-0240-sa

New Markers for Separating Benign From Malignant Mesothelial Proliferations: Are We There Yet?

2015· article· en· W1827919153 sur OpenAlexaff
Andrew Churg, Brandon S. Sheffield, Françoise Galateau-Sallé

Notice bibliographique

RevueArchives of Pathology & Laboratory Medicine · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOccupational and environmental lung diseases
Établissements canadiensVancouver Hospital and Health Sciences CentreVancouver General HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBAP1ImmunohistochemistryMesotheliomaContext (archaeology)PathologyMesothelial CellMalignancyFluorescence in situ hybridizationCancer researchBiologyMedicineGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CONTEXT: The separation of benign from malignant mesothelial proliferations is crucial to patient care but is frequently morphologically difficult. OBJECTIVE: To briefly review adjunctive tests claimed to be useful in this setting and to examine in detail 2 new tests: p16 fluorescence in situ hybridization (FISH) and BRCA1-associated protein 1 (BAP1) immunohistochemistry. DESIGN: Literature review with emphasis on p16 FISH and BAP1 immunohistochemistry. RESULTS: Glucose transporter-1, p53, insulin-like growth factor 2 messenger RNA-binding protein 3 (IMP-3), desmin, and epithelial membrane antigen have all been claimed to mark either benign or malignant mesothelial processes, but in practice they at best provide statistical differences in large series of cases, without being useful in an individual case. Homozygous deletion of p16 by FISH or loss of BAP1 has only been reported in malignant mesotheliomas and not in benign mesothelial proliferations. BAP1 appears to be lost more frequently in epithelial than mixed or sarcomatous mesotheliomas. Homozygous deletion of p16 by FISH is seen in pleural epithelial, mixed, and sarcomatous mesotheliomas, but it is much less frequent in peritoneal mesothelioma. The major drawback to both these tests is limited sensitivity; moreover, failure to find p16 deletion or BAP1 loss does not make a mesothelial process benign. CONCLUSIONS: In the context of a mesothelial proliferation, the finding of homozygous deletion of p16 by FISH or loss of BAP1 by immunohistochemistry is, thus far, 100% specific for malignant mesothelioma. The limited sensitivity of each test may be improved to some extent by running both tests.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,031

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0020,006
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations155
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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