Peripheral blood Th17 / Treg ratio increases in late asthmatic response
Notice bibliographique
Résumé
Background The late asthmatic response follows the early asthmatic response to allergen inhalation challenge (AIC) in half of atopic asthmatics (dual responder, DR). DRs develop airway hyperresponsiveness (AHR) and more prominent and sustained airway inflammation after AIC. While Th17 and regulatory T (Treg) cells have been studied in asthma, their roles have not been fully understood in isolated early responders (ERs) and DRs. A new method has been utilized to quantify immune cell subsets based on DNA methylation. Aims We aimed to measure immune cells and gene expression profiles in blood cells pre and post AIC, comparing ERs and DRs. Methods Eight ERs and 6 DRs underwent AIC. Blood cells were collected pre- and 2 hours post-challenge. DNA was used for epigenetic cell counting (Epiontis, Germany). Th17 and Treg cells were counted as percentage of demethylation of the cell-specific gene region; IL17A gene and FOXP3 Treg-specific demethylated regions, respectively, and the Th17/Treg ratio was compared between ERs and DRs using t-test. Gene expression was measured with Affymetrix Human Gene 1.0 ST array (Affymetrix, USA). After normalization, identified genes significantly correlated to each cell-type. GeneGo network analysis was performed for biological functions. Results The genes significantly correlated to Th17 and Treg counts were enriched in GeneGo analyses for Th17 functions and regulatory cellular functions, respectively. Th17/Treg was significantly higher at baseline in ERs compared to DRs (p 0.002). Th17/Treg significantly increased in DRs compared to ERs (p 0.023). Conclusion Th17/Treg imbalance may contribute to development of late phase bronchoconstriction and the associated AHR and inflammation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».