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Enregistrement W1828149617 · doi:10.1186/s12985-015-0369-2

The multifunctional protein CI of potyviruses plays interlinked and distinct roles in viral genome replication and intercellular movement

2015· article· en· W1828149617 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueVirology Journal · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaChina Scholarship Council
Mots-clésBiologyViral replicationMovement proteinVirologyMutantRNAPlasmodesmaTurnip mosaic virusCell biologyGeneticsVirusMolecular biologyCellPlant virusGenePotyvirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The multifunctional cylindrical inclusion (CI) protein of potyviruses contains ATP binding and RNA helicase activities. As part of the viral replication complex, it assists viral genome replication, possibly by binding to RNA and unwinding the RNA duplex. It also functions in viral cell-to-cell movement, likely via the formation of conical structures at plasmodesmata (PD) and the interaction with coat protein (CP). METHODS: To further understand the role of CI in the viral infection process, we employed the alanine-scanning mutagenesis approach to mutate CI in the infectious full-length cDNA clone of Turnip mosaic virus (TuMV) tagged by green fluorescent protein. A total of 40 double-substitutions were made at the clustered charged residues. The effect of these mutations on viral genome amplification was determined using a protoplast inoculation assay. All the mutants were also introduced into Nicotiana benthamiana plants to assess their cell-to-cell and long-distance movement. Three cell-to-cell movement-abolished mutants were randomly selected to determine if their mutated CI protein targets PD and interacts with CP by confocal microscopy. RESULTS: Twenty CI mutants were replication-defective (5 abolished and 15 reduced), one produced an elevated level of viral genome in comparison with the parental virus, and the remaining 19 retained the same replication level as the parental virus. The replication-defective mutations were predominately located in the helicase domains and C-terminal region. All 15 replication-reduced mutants showed delayed or abolished cell-to-cell movement. Nine of 20 replication-competent mutants contained infection within single cells. Five of them distributed mutations within the N-terminal 100 amino acids. Most of replication-defective or cell-to-cell movement-abolished mutants failed to infect plants systemically. Analysis of three randomly selected replication-competent yet cell-to-cell movement-abolished mutants revealed that the mutated CI failed to form regular punctate structures at PD and/or to interact with CP. CONCLUSIONS: The helicase domain and C-terminal region of TuMV CI are essential for viral genome replication, and the N-terminal sequence modulates viral cell-to-cell movement. TuMV CI plays both interlinked and distinct roles in replication and intercellular movement. The ability of CI to target PD and interact with CP is associated with its functional role in viral cell-to-cell movement.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,950
Score d'incertitude au seuil0,131

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle