Genetic Relationships among species of Populus (Salicaceae) based on nuclear genomic data<sup>1</sup>
Notice bibliographique
Résumé
The genus Populus comprises some of the most commercially exploited, pioneer forest trees distributed throughout the northern-hemisphere. The high level of morphological diversity, extensive inter-species hybridization, and low level of DNA sequence variation among species in this group have impeded the progress of taxonomic and phylogenetic studies. We used nuclear genomic data based upon inter simple sequence repeat (ISSR) variability, a highly variable class of molecular markers to determine the genetic relationships among species of the genus Populus. Species of the section Populus (Leuce) clustered together suggesting monophyly of the section Populus. The Eurasian members of section Populus (P. alba, P. davidiana, and P. tremula) showed closer genetic relationships to each other than to two North American aspens (P. tremuloides and P. grandidentata) of the same section. In contrast to previous phylogenetic studies, P. nigra showed a close genetic relationship to species of the section Tacamahaca. This relationship is in agreement with various phenotypic traits, interfertility and chemistry of bud exudates and serves as evidence for introgression between P. nigra and species of the section Tacamahaca. Overall, the genetic relatedness estimates based on nuclear ISSR data were congruent with phylogenetic trees based on other molecular (RFLP and DNA sequence) and morphological data, but provided better resolution in assessing the genetic relatedness among closely related taxa, and provided genetic evidence for previously suspected introgressions.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».