MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1829099848 · doi:10.1039/b400031e

Designer phytoalexins: probing camalexin detoxification pathways in the phytopathogen Rhizoctonia solaniElectronic supplementary information (ESI) available: 1H and 13C NMR spectral data for camalexin (1). See http://www.rsc.org/suppdata/ob/b4/b400031e/

2004· article· en· W1829099848 sur OpenAlexafffund
M. Soledade C. Pedras, Jun Liu

Notice bibliographique

RevueOrganic & Biomolecular Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics, phytochemicals, and oxidative stress
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPhytoalexinRhizoctonia solaniChemistryBiotransformationStereochemistryEnzymeBiochemistryMoietyBotanyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To probe the specificity of a camalexin detoxifying enzyme(s) produced by Rhizoctonia solani, the putative 5-camalexin hydroxylase (5-CAHY), the naturally occurring phytoalexin 1-methylcamalexin and designer phytoalexins in which the H-5 of camalexin was replaced with either a methyl group or a fluorine atom were synthesised. This investigation showed that biotransformation of 5-fluorocamalexin by R. solani was substantially slower than that of camalexin (12 days vs. six to eight hours), 5-methylcamalexin (5-6 days) or 1-methylcamalexin (5-6 days). Antifungal bioassays showed that 5-fluorocamalexin, 5-methylcamalexin and 1-methylcamalexin were more inhibitory to R. solani than camalexin, whereas their metabolic products displayed substantially lower inhibitory activity. It was concluded that detoxification via oxidation of the indole moiety of camalexins is predominant in the biotransformation of both camalexin and 5-methylcamalexin and likely catalysed by a specific 5-CAHY. By contrast, the pathways for detoxification of 1-methylcamalexin and 5-fluorocamalexin are likely catalysed by non-specific "house-keeping" enzymes. Most importantly, because 1- methylcamalexin showed stronger antifungal activity and was metabolised at substantially slower rate than camalexin this work suggested that, from a plant's perspective 1-methylcamalexin could be a more effective antifungal defence than camalexin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueOrganic & Biomolecular ChemistryMême sujetGenomics, phytochemicals, and oxidative stressTravaux en français237 207