Designer phytoalexins: probing camalexin detoxification pathways in the phytopathogen Rhizoctonia solaniElectronic supplementary information (ESI) available: 1H and 13C NMR spectral data for camalexin (1). See http://www.rsc.org/suppdata/ob/b4/b400031e/
Notice bibliographique
Résumé
To probe the specificity of a camalexin detoxifying enzyme(s) produced by Rhizoctonia solani, the putative 5-camalexin hydroxylase (5-CAHY), the naturally occurring phytoalexin 1-methylcamalexin and designer phytoalexins in which the H-5 of camalexin was replaced with either a methyl group or a fluorine atom were synthesised. This investigation showed that biotransformation of 5-fluorocamalexin by R. solani was substantially slower than that of camalexin (12 days vs. six to eight hours), 5-methylcamalexin (5-6 days) or 1-methylcamalexin (5-6 days). Antifungal bioassays showed that 5-fluorocamalexin, 5-methylcamalexin and 1-methylcamalexin were more inhibitory to R. solani than camalexin, whereas their metabolic products displayed substantially lower inhibitory activity. It was concluded that detoxification via oxidation of the indole moiety of camalexins is predominant in the biotransformation of both camalexin and 5-methylcamalexin and likely catalysed by a specific 5-CAHY. By contrast, the pathways for detoxification of 1-methylcamalexin and 5-fluorocamalexin are likely catalysed by non-specific "house-keeping" enzymes. Most importantly, because 1- methylcamalexin showed stronger antifungal activity and was metabolised at substantially slower rate than camalexin this work suggested that, from a plant's perspective 1-methylcamalexin could be a more effective antifungal defence than camalexin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».