EVALUATION OF FPA‐FTIR SPECTROSCOPY AS A TOOL IN THE DIFFERENTIATION OF<i>CAMPYLOBACTER JEJUNI</i>FROM<i>CAMPYLOBACTER COLI</i>ISOLATED FROM RETAIL CHICKEN SAMPLES
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT A method for differentiation of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli based on focal‐plane‐array Fourier transform infrared (FPA‐FTIR) spectroscopy was evaluated as an alternative to the current cumbersome methodology. Two types of reference data banks were constructed, one containing FTIR spectra of C. jejuni and C. coli strains, and the other containing FTIR spectra of 11 Campylobacter species. The FPA–FTIR method was tested by identifying 40 C. jejuni and 16 C. coli isolates from poultry, previously identified biochemically and by a multiplex polymerase chain reaction, through comparison of their spectra against the data banks. Employing the C. jejuni and C. coli data bank produced high sensitivity toward C. jejuni (95%) and C. coli (94%) and high overall specificity (95%). With the Campylobacter spp. data bank, the corresponding values were 82, 88 and 84%, respectively. We conclude that FPA‐FTIR spectroscopy is a valuable tool for the differentiation of C. jejuni and C. coli, particularly when C. jejuni and C. coli data banks are used. PRACTICAL APPLICATIONS Foodborne Campylobacter infections are highly prevalent, and therefore proper detection and identification of Campylobacter strains are of paramount importance. Accurate and fast methods for the identification of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli are pressing needs. This study presents a rapid, accurate method for differentiation between C. jejuni and C. coli based on Fourier transform infrared (FTIR) spectroscopy. By employing FTIR imaging instrumentation equipped with an infrared microscope and a focal‐plane‐array detector, thousands of spectra are recorded from each isolate in the amount of time a traditional FTIR spectrometer records a single spectrum. In turn, rich biochemical characterizations of bacterial strains, often termed “whole‐organism fingerprints,” are rapidly produced. Comparison of the FTIR spectra of unknown microorganisms against spectral databases of reference strains through the use of principal component analysis allows quick and accurate identification of C. jejuni and C. coli strains, offering an invaluable tool for food safety assurance and surveillance.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle