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Enregistrement W1829933356 · doi:10.1016/j.febslet.2015.07.042

Papaverine 7‐<i>O</i>‐demethylase, a novel 2‐oxoglutarate/Fe<sup>2+</sup>‐dependent dioxygenase from opium poppy

2015· article· en· W1829933356 sur OpenAlexafffund
Scott C. Farrow, Peter J. Facchini

Notice bibliographique

RevueFEBS Letters · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBerberine and alkaloids research
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésOpium PoppyBenzylisoquinolinePapaverinePapaverChemistryStereochemistryCodeineNoscapineOpiumAlkaloidBiosynthesisBiologyBiochemistryMorphineEnzymeBotanyPharmacology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Opium poppy (Papaver somniferum) produces several pharmacologically important benzylisoquinoline alkaloids including the vasodilator papaverine. Pacodine and palaudine are tri-O-methylated analogs of papaverine, which contains four O-linked methyl groups. However, the biosynthetic origin of pacodine and palaudine has not been established. Three members of the 2-oxoglutarate/Fe(2+)-dependent dioxygenases (2ODDs) family in opium poppy display widespread O-dealkylation activity on several benzylisoquinoline alkaloids with diverse structural scaffolds, and two are responsible for the antepenultimate and ultimate steps in morphine biosynthesis. We report a novel 2ODD from opium poppy catalyzing the efficient substrate- and regio-specific 7-O-demethylation of papaverine yielding pacodine. The occurrence of papaverine 7-O-demethylase (P7ODM) expands the enzymatic scope of the 2ODD family in opium poppy and suggests an unexpected biosynthetic route to pacodine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,555
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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