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Enregistrement W1829983658 · doi:10.4049/jimmunol.172.7.4359

Localization of the Domains in Runx Transcription Factors Required for the Repression of CD4 in Thymocytes

2004· article· en· W1829983658 sur OpenAlexaff
Janice C. Telfer, Emmett Hedblom, Michele K. Anderson, Micheline N. Laurent, Ellen V. Rothenberg

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNF-κB Signaling Pathways
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesUniversity of Massachusetts AmherstNational Science Foundation
Mots-clésPsychological repressionTranscription factorRUNX1BiologyTranscription (linguistics)CD8Molecular biologyCell biologyGeneticsGene expressionGeneImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The runt family transcription factors Runx1 and Runx3 are expressed in developing murine thymocytes. We show that enforced expression of full-length Runx1 in CD4(-)CD8(-) thymocytes results in a profound suppression of immature CD4/CD8 double-positive thymocytes and mature CD4 single-positive thymocytes compared with controls. This effect arises from Runx1- or Runx3-mediated repression of CD4 expression, and is independent of positively selecting signals. Runx1 is able to repress CD4 in CD4/CD8 double-positive thymocytes, but not in mature splenic T cells. Runx-mediated CD4 repression is independent of association with the corepressors Groucho/TLE or Sin3. Two domains are required for complete Runx-mediated CD4 repression. These are contained within Runx1 aa 212-262 and 263-360. The latter region contains the nuclear matrix targeting sequence, which is highly conserved among runt family transcription factors across species. The presence of the nuclear matrix targeting sequence is required for Runx-mediated CD4 repression, suggesting that Runx transcription factors are stabilized on the CD4 silencer via association with the nuclear matrix.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations82
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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