MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1830908103 · doi:10.1093/hmg/ddv286

Mutations in the histamine<i>N</i>-methyltransferase gene,<i>HNMT</i>, are associated with nonsyndromic autosomal recessive intellectual disability

2015· article· en· W1830908103 sur OpenAlexafffund
Abolfazl Heidari, Chanakan Tongsook, Reza Najafipour, Luciana Musante, Nasim Vasli, Masoud Garshasbi, Hao Hu, Kirti Mittal, Amy J. M. McNaughton, Kumudesh Sritharan, Melissa M. Hudson, Henning Stehr, Mohammad Moradi, Hossein Darvish, Muhammad Rafiq, Hossein Mozhdehipanah, Ali Rashidinejad, Shahram Samiei, Mohsen Ghadami, Christian Windpassinger, Gabriele Gillessen‐Kaesbach, Andreas Tzschach, Iltaf Ahmed, Anna Mikhailov, Dimitrios J. Stavropoulos, Melissa T. Carter, S Keshavarz, Muhammad Ayub, Hossein Najmabadi, Xudong Liu, Hans Hilger Ropers, Peter Macheroux, John B. Vincent

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePolyamine Metabolism and Applications
Établissements canadiensQueen's UniversitySickKids FoundationUniversity of TorontoHospital for Sick ChildrenOntario GenomicsCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchQazvin University of Medical SciencesMax-Planck-Gesellschaft
Mots-clésBiologyExome sequencingHistamine N-methyltransferaseIn silicoGeneticsHistamineIntellectual disabilityGeneMutantMutationPharmacologyReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Histamine (HA) acts as a neurotransmitter in the brain, which participates in the regulation of many biological processes including inflammation, gastric acid secretion and neuromodulation. The enzyme histamine N-methyltransferase (HNMT) inactivates HA by transferring a methyl group from S-adenosyl-l-methionine to HA, and is the only well-known pathway for termination of neurotransmission actions of HA in mammalian central nervous system. We performed autozygosity mapping followed by targeted exome sequencing and identified two homozygous HNMT alterations, p.Gly60Asp and p.Leu208Pro, in patients affected with nonsyndromic autosomal recessive intellectual disability from two unrelated consanguineous families of Turkish and Kurdish ancestry, respectively. We verified the complete absence of a functional HNMT in patients using in vitro toxicology assay. Using mutant and wild-type DNA constructs as well as in silico protein modeling, we confirmed that p.Gly60Asp disrupts the enzymatic activity of the protein, and that p.Leu208Pro results in reduced protein stability, resulting in decreased HA inactivation. Our results highlight the importance of inclusion of HNMT for genetic testing of individuals presenting with intellectual disability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,382
Score d'incertitude au seuil0,901

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHuman Molecular GeneticsMême sujetPolyamine Metabolism and ApplicationsTravaux en français237 207