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Enregistrement W1832212425 · doi:10.1139/cjc-2013-0285

A sensitive biosensing strategy for DNA detection based on graphene oxide and T7 exonuclease assisted target recycling amplification

2013· article· en· W1832212425 sur OpenAlexvenueno aff
Haibo Wang, Li‐Juan Ou, Ke‐Jing Huang, Xin-Ge Wen, Lingling Wang, Yan‐Ming Liu

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExonuclease IIIBiosensorChemistryDNAMolecular beaconExonucleaseDetection limitBiophysicsCombinatorial chemistryNanotechnologyOligonucleotideDNA polymeraseBiochemistryMaterials scienceChromatographyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A fluorescence biosensing strategy based on graphene oxide (GO) was reported for simple, rapid, sensitive, and selective DNA detection by T7 exonuclease assisted target recycling amplification. Due to the super fluorescence quenching efficiency of GO, the fluorescein amiditelabeled signal probe was firstly adsorbed onto the surface of GO and the fluorescence was quenched. Owing to its excellent selectivity for double-stranded DNA, T7 exonuclease was chosen as a signal-amplifying biocatalyst to improve the detection sensitivity. In the presence of target DNA, the signal probe could bind with target DNA and form a DNA duplex structure to trigger the digestion of the signal probe by T7 exonuclease, leading to the recycling of target DNA and the increasing of fluorescence intensity. Upon the recycling use of target DNA, this method achieved a high sensitivity towards target DNA with a detection limit of 0.3 pmol/L, which was lower than previously reported for GO-based DNA biosensors. Moreover, it does not require complex modifications of the molecular beacon and time-consuming thermal cycling procedures. Thus, the simple strategy provides a universal biosensing platform for DNA detection and it could find wide applications in DNA damage analysis and diagnostics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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