Metaproteomics of aquatic microbial communities in a deep and stratified estuary
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Here we harnessed the power of metaproteomics to assess the metabolic diversity and function of stratified aquatic microbial communities in the deep and expansive Lower St. Lawrence Estuary, located in eastern Canada. Vertical profiling of the microbial communities through the stratified water column revealed differences in metabolic lifestyles and in carbon and nitrogen processing pathways. In productive surface waters, we identified heterotrophic populations involved in the processing of high and low molecular weight organic matter from both terrestrial (e.g. cellulose and xylose) and marine (e.g. organic compatible osmolytes) sources. In the less productive deep waters, chemosynthetic production coupled to nitrification by MG-I Thaumarchaeota and Nitrospina appeared to be a dominant metabolic strategy. Similar to other studies of the coastal ocean, we identified methanol oxidation proteins originating from the common OM43 marine clade. However, we also identified a novel lineage of methanol-oxidizers specifically in the particle-rich bottom (i.e. nepheloid) layer. Membrane transport proteins assigned to the uncultivated MG-II Euryarchaeota were also specifically detected in the nepheloid layer. In total, these results revealed strong vertical structure of microbial taxa and metabolic activities, as well as the presence of specific "nepheloid" taxa that may contribute significantly to coastal ocean nutrient cycling.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle