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Enregistrement W1833156023 · doi:10.1111/mmi.12034

Prime time for minor subunits of the type <scp>II</scp> secretion and type <scp>IV</scp> pilus systems

2012· letter· en· W1833156023 sur OpenAlexafffund
Lori L. Burrows

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2012
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPilusBiologySecretionProtein subunitCell biologyBacterial conjugationEscherichia coliDNABiochemistryPlasmid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The type II secretion system (T2SS) exports folded proteins from the periplasms of Gram-negative bacteria. The type IV pilus system (T4PS) is a multifunctional machine used for adherence, motility and DNA transfer in bacteria and archaea. Partial sequence identity between the two systems suggests that they are related and might function via a similar mechanism, the dynamic assembly and disassembly of pseudopilus (T2SS) or pilus (T4PS) filaments. The major subunit in each system is thought to form the bulk of the (pseudo)pilus, while minor (low-abundance) subunits have proposed roles in assembly initiation, antagonism of disassembly, or modulation of (pseudo)pilus functional properties. In this issue, Cisneros et al. () extend their previous finding that pseudopilus assembly is primed by the minor pseudopilins, showing that the same proteins can initiate assembly of Escherichia coli T4P. Similarly, they show that the E. coli minor pilins prime the polymerization of T2S pseudopili, although unlike genuine pseudopili, the chimeric filaments did not support secretion. This work reinforces the notion of a common assembly mechanism for the T2S and T4P systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,400
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0040,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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