Distribution of Temperature Tolerance Quantitative Trait Loci in Arctic Charr (<i>Salvelinus alpinus</i>) and Inferred Homologies in Rainbow Trout (<i>Oncorhynchus mykiss</i>)
Notice bibliographique
Résumé
We searched for quantitative trait loci (QTL) affecting upper temperature tolerance (UTT) in crosses between the Nauyuk Lake and Fraser River strains of Arctic charr (Salvelinus alpinus) using survival analysis. Two QTL were detected by using two microsatellite markers after correcting for experiment-wide error. A comparative mapping approach localized these two QTL to homologous linkage groups containing UTT QTL in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). Additional marginal associations were detected in several families in regions homologous to those with QTL in rainbow trout. Thus, the genes underlying UTT QTL may antedate the divergence of these two species, which occurred by approximately 16 MYA. The data also indicate that one pair of homeologs (ancestrally duplicated chromosomal segments) have contained QTL in Arctic charr since the evolution of salmonids from a tetraploid ancestor 25-100 MYA. This study represents one of the first examples of comparative QTL mapping in an animal polyploid group and illustrates the fate of QTL after genome duplication and reorganization.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».