Identification of putative two-component regulatory systems in the bovine pathogen Mannheimia haemolytica A1, and preliminary characterization of the NarQ/P system
Notice bibliographique
Résumé
The complete genome sequence of the bovine pathogen Mannheimia haemolytica A1 was analyzed by blast searches for the presence of two-component regulatory system proteins. Five complete sets of putative two-component systems were identified, and the NarQ/P system was further investigated. in silico analysis of the NarQ and NarP proteins showed features that are typical of the sensor and response regulator proteins. A narP knock-out mutant was constructed. The narP mutant has lost its ability to respond to NaNO(3) in the media and fail to alter the expression of several proteins. One of the proteins that showed increased production in the parent strain in response to NaNO(3) was analyzed by matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight MS. Unexpectedly, the protein was identified to be FbpA, a periplasmic component of the iron transporter system. Sequence analysis of the promoter region of fbpA identified motifs typical for NarP-regulated genes. The expression of the leukotoxin gene was also altered in the narP mutant as shown by Western immunoblot analysis and reverse transcription-PCR.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».