High diversity of fungi recovered from the roots of mature tanoak (<i>Lithocarpus densiflorus</i>) in northern California
Notice bibliographique
Résumé
We collected mature tanoak ( Lithocarpus densiflorus (Hook. & Arn.) Rehder) roots from five stands to characterize the relative abundance and taxonomic richness of root-associated fungi. Fungi were identified using polymerase chain reaction (PCR), cloning, and sequencing of internal transcribed spacer (ITS) and 28S rDNA. A total of 382 cloned PCR inserts were successfully sequenced and then classified into 119 taxa. Of these taxa, 82 were basidiomycetes, 33 were ascomycetes, and 4 were zygomycetes. Thirty-one of the ascomycete sequences were identified as Cenococcum geophilum Fr. with overall richness of 22 ITS types. Other ascomycetes that form mycorrhizal associations were identified including Wilcoxina and Tuber as well as endophytes such as Lachnum , Cadophora , Phialophora , and Phialocephela . The most abundant mycorrhizal groups were Russulaceae ( Lactarius , Macowanites , Russula ) and species in the Thelephorales ( Bankera , Boletopsis , Hydnellum , Tomentella ). Our study demonstrates that tanoak supports a high diversity of ectomycorrhizal fungi with comparable species richness to that observed in Quercus root communities.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».